Секция „Физико-математически и геологически науки“ обединява стипендианти на Фондация „Александър фон Хумболт“ (включително и стипендианти по програмата Феодор Люнен), които работят във всички области на експерименталната и теоретичната физика, на чистата и приложната математика, а също и в сферата на геологическите науки. Домакини на изследователските им престои са водещи специалисти от реномирани германски университети или институти „Макс Планк“.
Хумболтианците от секцията извършват научно-експериментална и преподавателска дейност в едни от най-престижните научни и образователни институции в България – Българската академия на науките, Софийския университет „Св. Климент Охридски“, Техническия университет  – София, Великотърновския университет „Св. св. Кирил и Методий“, Нов български университет и др.